企業使用傳統的印章擁有諸多的不便利性，有時外出辦公需要簽訂協議而沒有攜帶印章很可能會影響生意往來，而有的小型公司管理混亂市場也會一時找不到印章的現象。因此電子印章的啟用對于企業來說充滿了便利性與良使用感受。同時企業在使用電子印章時也有一些注意事項。
1、充分保護有效的表現形式
有品質的電子印章在使用的過程中要注意對其進行保護，一般建議使用電子印章時可以設置身份驗證，只有當驗證了文件的真實有效性之后才能使用電子印章，否則電子印章禁止彈出使用。這樣做可以保護電子印章不被不法分子盜用而致使公司承受不明的損失。
2、高效實施一對一管理
價格合理的電子印章在使用的時候一定要遵循一對一管理的辦法，即一個實物印章只允許對應一個電子印章，不允許出現一個實物對應多個電子設備的情況。同時管理人員要清楚的掌控每一個電子印章的去向，保障企業的財務安全。
3、嚴格的采用相匹配的技術
為了保證電子印章所加蓋的文件能夠與紙張文件擁有一樣的外觀屬性，在電子印章紙張的選擇上應該采用特殊的數字紙張技術，其紙張技術有多個類別，可以根據實際情況進行選擇。這種紙張技術擁有為強大的特性，不論多復雜的版面都可以表現出來，并且不可篡改不可分割。
企業在使用電子印章時一定要更加具備安全防范意識，在電子印章使用時要進行數據驗證保證文件安全才可啟用，并且一個實物印章對應一個電子印章，管理人員還需要對其去向進行監管。同時非常重要的是電子印章所對應的數字紙張也有規定，使用正規的數字紙張技術還可以保證文件的安全與驗證。